ルートディレクトリ 【root directory】

ルートディレクトリとは、最上階層にあるディレクトリのことを言います。

SEO対策に関連するケースは下記のような場合です。

robots.txt を設置する
Google Sitemap や Yahoo! Site Explorer へサイトマップを
登録する際の認証ファイルのアップロード
この場合の「ルートディレクトリ」とは、
サイトのトップページ（ index.html や index.php など）を置く階層のことです。

サーバーにより「ルートディレクトリ」の名前は異なりますが、
「htdocs」「public_html」「httpdocs」「www」
などが多く使われています。

例）
ロリポップの場合「/」
さくらインターネットの場合「www」
Xserverの場合「ドメイン名/public_html/」
なお、「ディレクトリ」と「フォルダ」は同義語です。
Wndows98 や WindowsXP、MacOS などでは「フォルダ」、
MS-DOS や UNIX系では「ディレクトリ」と呼びます。

サイトを置くためのサーバーの OS は、UNIX 系が使用されるケースが多いため、
「ディレクトリ」と呼ばれるケースが目立ちます。